錄組分析平臺.png)
真核生物有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析平臺
基于已知的基因組序列和注釋信息，以新一代高通量轉(zhuǎn)錄組測序（RNA-Seq）數(shù)據(jù)作為輸入，根據(jù)測序數(shù)據(jù)與參考基因組的序列比對，識別新的轉(zhuǎn)錄位點（新基因）、新的可變剪接事
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真核生物無參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析平臺
以新一代高通量轉(zhuǎn)錄組測序（RNA-Seq）數(shù)據(jù)作為輸入，從頭（de novo）組裝轉(zhuǎn)錄本，構(gòu)建轉(zhuǎn)錄組（Unigene庫），并對Unigene進行功能鑒定，以及結(jié)構(gòu)和表達量分析。
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蛋白質(zhì)組分析平臺
可以進行標準分析和個性化分析，其中標準分析包括：蛋白表達分析和蛋白注釋分析。設(shè)定參數(shù)后點擊提交進行分析，分析完成后在流程定制頁面下生成標準化結(jié)題報告，實現(xiàn)一鍵式
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代謝組分析平臺
代謝組學(xué)分析平臺基于色譜質(zhì)譜等產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，借助于統(tǒng)計學(xué)方法研究生物體內(nèi)代謝物的變化狀況，促進對生物生理活動的理解。
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全轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析平臺
可以全局的展示多種RNA以及差異情況，對4種RNA之間進行共表達分析，ceRNA網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建，關(guān)鍵RNA篩選以及關(guān)鍵mRNA的KEGG整合通路網(wǎng)絡(luò)分析。
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有參全長轉(zhuǎn)錄組（ONT）分析平臺
基于參考基因組序列和nanopore轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)進行相關(guān)分析，內(nèi)容包括：數(shù)據(jù)質(zhì)控（接頭、低質(zhì)量過濾），轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)分析（可變剪切、APA分析、CDS預(yù)測、轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測等）
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全基因組重測序分析平臺
面向無任何生物信息基礎(chǔ)的科研工作者開發(fā)的集成式分析流程，其部署在高性能服務(wù)器上，可以快速完成數(shù)據(jù)質(zhì)控、序列比對、SNP/InDel/SV突變檢測、突變注釋、突變基因
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微生物多樣性分析平臺
可以進行標準分析和個性化分析，其中標準分析包括：物種分類分析（包括：群落結(jié)構(gòu)分析、物種Heatmap、物種系統(tǒng)進化樹）、單樣品多樣性分析（α- 多樣性指數(shù)、稀釋曲線
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宏基因組分析平臺
一款結(jié)合多年宏基因組項目分析經(jīng)驗開發(fā)的一鍵式標準化集成式分析平臺：分析涵蓋了目前微生物宏基因組研究的主流分析內(nèi)容，分析內(nèi)容豐富全面，分析結(jié)果以結(jié)題報告的形式給出。
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聯(lián)分析平臺.png)
全基因組關(guān)聯(lián)分析平臺
借助一定的統(tǒng)計學(xué)方法，在全基因組范圍內(nèi)尋找與表型差異相關(guān)的核苷酸變異的分析方法，在人類復(fù)雜疾病和動植物復(fù)雜性狀的功能基因挖掘中廣泛應(yīng)用。
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學(xué)有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析平臺.png)
醫(yī)學(xué)有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析平臺
可以進行標準分析和個性化分析，其中標準分析包括：差異表達基因分析、基因結(jié)構(gòu)分析、新基因分析等。設(shè)定參數(shù)后點擊提交進行分析，分析完成后在流程定制頁面下生成標準化
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醫(yī)學(xué)小RNA測序分析平臺
miRNA的鑒定與預(yù)測；miRNA表達量分析；miRNA靶基因預(yù)測；miRNA靶基因注釋分類及富集等。設(shè)定參數(shù)后點擊提交進行分析，分析完成后在基本分析頁面下生成標準化
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醫(yī)學(xué)長鏈非編碼RNA測序分析平臺
差異表達基因分析、基因結(jié)構(gòu)分析、新lncRNA預(yù)測及靶基因預(yù)測等。設(shè)定參數(shù)后點擊提交進行分析，分析完成后在流程定制頁面下生成標準化結(jié)題報告
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tab文件.png)
表格文件轉(zhuǎn)tab文件
將xls/xlsx格式的excel文件轉(zhuǎn)換為tab分隔的文本文件，包含多個sheet的文件，每個sheet都會轉(zhuǎn)換為一個文本文件，文件名為sheet的名稱。
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基因功能注釋
對通過與數(shù)據(jù)庫的比對，對FASTA格式文件的序列進行功能注釋。主要關(guān)注Result/Integrated_Function.annotation.xls這個表格和KEEG分析出的代謝通路圖。
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BLAST
基于局部比對算法的序列比對搜索工具。BLAST程序可根據(jù)database和infile文件序列類型自動從四種比對程序（blastn、blastp、blastx和tblastn）中選擇合適的程序
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繪制GO、KEGG分類富集圖
對給定的基因集結(jié)合注釋信息繪制GO分類富集圖、KEGG分類富集及通路富集圖，計算出基因的P_value和Corrected_P-value，定位基因最可能相關(guān)的GO term。
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根據(jù)ID列表提取fasta序列
根據(jù)ID列表提取fasta序列：根據(jù)給定的序列ID，到目標序列文件中提取出對應(yīng)ID的序列。注意：ID文件的后綴只能是txt、list、id，且必須為文本文件
立即打開加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析
加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)是一種從表達數(shù)據(jù)中挖掘基因模塊（module）信息的算法，可以用于分析各種表達譜數(shù)據(jù)，不僅是芯片數(shù)據(jù)，還可以用于二代測序數(shù)據(jù)得到
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提取相應(yīng)ID行信息
數(shù)據(jù)提取類工具，提取相應(yīng)ID行信息，是按照輸入文件包含的ID列表從指定的目標文件中提取相應(yīng)的行。輸入文件只能為Tab分隔的文本文件，不支持excel文件。
立即打開MEGA
使用MEGA軟件構(gòu)建進化樹，畫樹輸入文件，F(xiàn)asta格式，文件名必須要以.fa 或 .fas 或 .fasta 結(jié)尾。Align方法，推薦使用Muscle
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簡單重復(fù)序列分析
分析fasta序列的SSR(Simple Sequence Repeat)標記，用于后續(xù)的實驗分析及驗證，主要應(yīng)用于轉(zhuǎn)錄本或者Unigene、CDS、EST等序列的SSR標記檢測，及標記結(jié)果的引物設(shè)計。
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